Un científico construye un cromosoma artificialmente, según un diario

Domingo, 7 octubre 2007 IBLNEWS, AGENCIAS Un célebre científico estadounidense, Craig Venter, asegura haber construido un cromosoma sintético en un laboratorio, afirma el diario británico The Guardian este sábado. Venter se dispone a anunciar su descubrimiento de forma inminente, quizás el próximo lunes, afirmó el diario. El descubrimiento representa "un paso filosófico muy importante en la Historia", explicó al diario. "Vamos a ser capaces de pasar de la lectura del código genético a la posibilidad de escribirlo. Eso nos da la capacidad hipotética para hacer cosas que no han sido contempladas antes", explicó. El cromosoma que Venter y su equipo recrearon se denomina Mycoplasma laboratorium, y en la etapa final de su elaboración, será transplantado a una célula viva, de la que podrá "tomar el control" y convertirse en una nueva forma viviente. Pat Mooney, director de la organización canadiense ETC Group, un grupo de reflexión canadiense sobre bioética, aseguró al Guardian que lo que Venter acaba de crear es "un chasis sobre el puedes construir casi todo lo que quieras". "Podría convertirse una contribución a la Humanidad tan grande como un nuevo medicamento, o una enorme amenaza, como un arma biológica", advirtió.
© IBLNEWS. New York 2007

Crean bacteria sintética en laboratorio

Washington, 29 jun (PL) Un grupo de expertos logró producir con éxito una bacteria diseñada al transferir material genético de otra, indica un artículo divulgado en la revista Science.

Ambos microbios son idénticos, destaca el texto, que también afirma como los científicos pretenden usar su técnica para diseñar bacterias a medida y con ello contribuir a la solución de muchas de las enfermedades del planeta.

Craig Venter, pionero en la secuenciación del genoma humano y autor principal del trabajo, expresó que gráficamente el experimento equivale a transformar una computadora Macintosh en una PC, insertando un nuevo software.

El científico, quién dirige su propio instituto en Rockville, Maryland, agregó que espera poder crear células artificiales.

En las páginas de Science se expone paso a paso el proceso seguido. El minucioso aislamiento del genoma de la bacteria donante, "lavado" una y otra vez de proteínas, tratado con agentes que lo hicieran resistente a determinado antibiótico.

Todo ello, con el máximo cuidado para prevenir contaminaciones y no romper el ADN. La bacteria que sobrevivió portaba sólo los genes que habían sido implantados.

Hechas todas las comprobaciones, se determinó que los profesionales consiguieron realizar un trasplante genómico, y con ello crearon una especie nueva. Se ha subido un peldaño importantísimo hacia la viabilidad de la biología sintética, resalta el documento.

Sin embargo, los especialistas no están seguros en cómo el nuevo ADN reprogramó parte de la bacteria o qué pasó con el código genético original.

"Creo que no sabemos con certeza cómo el genoma donante toma el control", dijo el investigador Ham Smith del Instituto Venter.

Fue resuelto uno de los mayores y más complejos rompecabezas matemáticos

Martes 20 de Marzo de 2007 
09:24 
AFP

WASHINGTON.- Un equipo internacional de matemáticos anunció que construyó una compleja estructura teórica en 248 dimensiones, resolviendo un rompecabezas centenario que podría ser utilizado para probar teorías sobre la estructura del cosmos.

Luego de cuatro años de intensos esfuerzos, 18 grandes matemáticos y científicos informáticos de Estados Unidos y Europa dijeron que resolvieron "E8", un problema descubierto en 1887 pero que tuvo que esperar hasta la era de los supercomputadores y las mentes unidas por Internet para ser resuelto.

El E8 es la madre de los denominados grupos de Lie, una categoría de problemas inventada por un matemático noruego del siglo XIX, Sophus Lie, para estudiar la simetría.

Esferas, cilindros o conos son ejemplos familiares de objetos simples y simétricos tridimensionales. Pero E8 es una especie de origami geométrico que tiene 248 dimensiones.

"(E8) es tan complicado como puede llegar a ser la simetría", dijo David Vogan, profesor de matemáticas del Instituto Tecnológico de Massachusetts (MIT), que participó del cálculo.

"Las matemáticas casi siempre pueden ofrecer otro ejemplo que es más difícil que el que uno está estudiando, pero en el caso de los grupos Lie, E8 es el más complejo", explicó.

Resolver E8 fue un desafío gigantesco, aseguraron los científicos, que lo compararon con el proyecto de Genoma Humano, que pacientemente desentrañó el código genético humano.

Mientras el genoma humano, que contiene toda la información genética de una célula, es menor a un Gigabyte de tamaño, el resultado del cálculo del E8, que contiene toda la información sobre E8, tiene un tamaño de 60 Gigabytes, dijeron.

Esto equivale a almacenar 45 días de música continua en formato MP3. Escrita en un papel, la solución cubriría un área del tamaño de Manhattan.

"Este logro innovador es significativo tanto como un avance en el conocimiento básico, así como un gran avance en el uso de informática a gran escala para solucionar problemas matemáticos complejos", estimó Jeffrey Adams, líder del proyecto y profesor de matemáticas de la Universidad de Maryland.

Un dibujo de E8 resuelto, divulgado por el MIT, muestra una especie de colorida carpa de circo construida, como en un juego infantil, con densos peldaños interconectados.

"Nunca podemos confiar en representar la estructura por entero, es una abstracción matemática", dijo el investigador alemán Marc van Leeuwen, de la Universidad francesa de Poitiers.

"Se pueden hacer algunos bonitos dibujos, pero una hoja de papel tiene solo dos dimensiones, por lo que nunca se verá el objeto real", explicó.

Llevó cuatro años llegar al cálculo de E8 y una poco habitual colaboración entre ambos lados del Atlántico.

"La literatura sobre este tema es muy densa y muy difícil de entender", explicó Vogan. "Incluso después de entender las matemáticas subyacentes, nos llevó luego más de dos años implementarlo en una computadora".

Uno de los mayores dolores de cabeza fue encontrar una computadora lo suficientemente potente como para resistir el cálculo.

Un experto independiente dijo que la decodificación de E8 era "un avance muy importante" para la física, porque podría ser usado para probar teorías clave sobre las simetrías básicas de la naturaleza.

Entre estas simetrías está la estructura del cosmos -creado por el Big Bang hace unos 13 mil millones de años- y las partículas básicas, estimó Hermann Nicolai, director del Instituto Albert Einstein de Potsdam, en Alemania.

El equipo de 18 miembros, denominado Atlas, incluyó también matemáticos de las universidades francesas de Poitiers y Lyon.

Usan el ADN de los elefantes contra el comercio de marfil

27/02/2007 - 18:34
IBLNEWS, AGENCIAS

Un grupo de científicos alarmados por el incremento de las matanzas de elefantes a los que se captura por el marfil han ideado un método para seguir el rastro de los colmillos y señalar los "puntos calientes" del comercio ilícito.

La muerte de elefantes por sus colmillos ha llegado a niveles no vistos desde que en 1989 entrara en vigor un tratado que prohibía el comercio de marfil, y el incremento se ha visto alimentado por una creciente demanda en Asia, según los científicos.

Se debe hacer algo ahora o nos enfrentamos al peligro de que desaparezcan estos mamíferos, que viven en Asia y África, añaden.

"Muchas, muchas personas no son conscientes de lo graves que se han vuelto de nuevo los problemas", dijo en una entrevista el director de la investigación, Samuel Wasser, del Centro de Biología de Conservación de la universidad de Washington.

La lucha contra el comercio ilegal ha sufrido trabas por la incapacidad de las autoridades para averiguar la procedencia del marfil que hay en el mercado negro.

Los investigadores reunieron información genética de varias poblaciones de elefantes africanos usando tejidos y muestras de estiércol. Así han creado un mapa basado en el ADN de las distintas poblaciones.

Los investigadores están trabajado con las autoridades internacionales y esperan que su método para seleccionar el origen del colmillo pueda ayudar en los esfuerzos contra la caza furtiva.

"Lo que intentamos hacer es localizar los 'puntos calientes' de la caza furtiva", dijo Wasser. Esta información puede ayudar también a detectar las rutas del comercio, añadió.

Quedan aproximadamente unos 400.000 elefantes en estado salvaje, la mayoría en África. Antes del tratado de 1989, los cazadores furtivos sacrificaron unos 87.000 elefantes, aproximadamente entre el ocho y el nueve por ciento de la población mundial en aquel momento, dijo Wasser.

"Ahora nos acercamos a los aproximadamente 25.000 elefantes muertos al año", aseguró. Esa cifra supone un seis ó un siete por ciento de la población mundial.

El precio del marfil de alta calidad se dobló entre 1989 y 2004, y casi se ha cuadriplicado en los últimos dos años, alimentado por un mercado floreciente en China y en otras partes de Asia.

Wasser dijo que los países occidentales deben reanudar los esfuerzos para aplicar la ley contra el comercio de marfil, que se había prácticamente estancado tras el tratado de 1989.

BIODIVERSIDAD: El libro de la vida en código de barras

Crédito: UN/DPI Photo

Por Stephen Leahy

TORONTO, 20 feb (IPS) - Expertos descubrieron 50 nuevas especies de ave tras el primer muestreo genético de casi todas las 690 conocidas en América del Norte. El proceso fue posible gracias a una novedosa técnica de análisis que tarda apenas tres horas y cuesta sólo cinco dólares.

Un proceso similar de análisis del ADN (ácido desoxirribo nucleico) sumó seis a las 87 especies ya registradas de murciélago en Guyana. El ojo y el oído humanos casi no distinguen las nuevas especies de aquellas de las que ya se tenía conocimiento.

Pero el análisis genético muestra que los ADN de diversas variedades evolucionan por caminos diferentes desde hace millones de años, según investigaciones publicadas el domingo por la revista científica británica Molecular Ecology Notes (Notas de Ecología Molecular).

"El código de barras del ADN transformará los esfuerzos para la protección y conservación de la biodiversidad mundial", dijo a IPS Paul Herbert, del Instituto de Biodiversidad de Ontario en la canadiense Universidad de Guelph.

"No se puede proteger lo que no se puede identificar", explicó el científico.

El hábitat del zarapico, un ave costera norteamericana, sufre una tremenda presión del sector de la construcción y por el cambio climático. Ahora se sabe que, en realidad, esta especie tiene dos formas distintas, cuyos rastros evolutivos se bifurcaron hace 2,5 millones de años.

"¿Cómo es posible desarrollar estrategias para preservar entidades genéticas muy diferentes si se ignora que lo son? Nuestro trabajo es hallar la primera evidencia molecular de algunas de esas divisiones", explicó Herbert.

La importancia de la protección y conservación de la diversidad biológica radica en que los organismos vivos juegan funciones importantes en todos los ecosistemas, como la purificación del agua y el aire del que todos los seres, incluidos los humanos, dependen para sobrevivir.

La diversidad de especies interactuantes es la clave de la salud y resistencia de los ecosistemas, según los expertos.

Usar el ADN para la identificación de las especies no es una práctica nueva, pero lo que desarrollaron Herbert y su equipo es un mecanismo que estandariza, acelera y abarata el análisis.

"Tres horas y cinco dólares en sustancias químicas" es todo lo necesario para identificar una especie a partir de una muestra de tejido, explicó.

El ADN, que aparece en todos los seres vivientes, es una molécula compleja que contiene todas las instrucciones genéticas para que un organismo se desarrolle.

A nadie sorprende que el ADN de un ser humano es diferente y más complejo que el de un gusano... aunque el de un ratón sí es similar al de un humano. Las diferencias entre los millones de piezas que componen el ADN de dos distintas especies animales son muy difíciles de hallar.

Luego de 20 años de investigación y otros varios de pruebas, Herbert logró identificar la porción de un gen llamado citochrome c oxidase I (COI), que, al parecer, es el código de barras de todas las especies animales.

A partir de este avance, los inspectores aduaneros y los guardaparques podrán determinar si un cargamento de pieles o de filetes animales proceden de especies cuya caza es ilegal, indicó el experto.

También los funcionarios de los aeropuertos podrán identificar los restos de las aves que terminan en la turbina de los aviones, con desastrosas consecuencias para ellas y, en ocasiones, también para los aparatos.

Miles de esos "ataques aviares" se registran cada año y podrían evitarse identificando los animales e impidiendo que aniden cerca de los aeropuertos.

La nueva tecnología ya se usa para establecer los límites de los parques nacionales de Madagascar y para entender el impacto del desarrollo económico en las selvas amazónicas.

Y ninguna de esas aplicaciones es tan controvertida como el descubrimiento, chocante para los ornitólogos y aficionados al avistamiento de aves, de 15 nuevas especies en Estados Unidos y Canadá.

"Hay 15 especies pasadas por alto, genéticamente distintas pero que parecen iguales a otras", dijo a IPS uno de los autores del estudio publicado por Molecular Ecology Notes, Mark Stoeckle, de la Universidad Rockefeller de Nueva York.

Considerando cuán bien estudiadas estaban las aves norteamericanas, este hallazgo es toda una sorpresa, según Stoeckle.

"¿Puede usarse el ADN por sí solo para definir una especie? Quizás en el futuro, pero ahora necesitamos la opinión de los expertos", agregó.

Algunos de esos expertos habían afirmado antes que esta tecnología aún no ha probado su rigurosidad. La identificación y clasificación de especies es el objeto de una disciplina denominada taxonomía, con una rica tradición científica de más de tres siglos.

De cualquier manera, los nuevos análisis indican que "existen varios casos de profundas divergencias genéticas dentro de lo que hoy se considera una especie única", sostuvo Herbert.

Aunque especies de aves puedan parecer muy similares al ojo humano, un espécimen no se apareará con otro que tenga un "código de barras" distinto.

Mientras, las nuevas especies de aves y murciélagos aún no tienen un nombre que las distinga. El asunto es objeto de una intensa discusión científica.

"Si decimos que el ADN es a partir de ahora el único medio para identificar especies, se levantarían las plumas de unos cuantos cogotes", observó Herbert.

La taxonomía constituye una tarea difícil y tediosa y ganar experiencia lleva muchos años.

Stoeckle descubrió hace tiempo un cienpiés inusual en el Parque Central de Nueva York. Le insumió cuatro años de trabajo a expertos en Italia identificar el espécimen como de una nueva especie, para lo cual debieron compararlo con todos los cienpiés antes identificados.

El código de barras del ADN aceleraría mucho el proceso, indicó el científico.

Por otra parte, esta nueva tecnología permitiría identificar todos los seres vivientes del planeta. Hoy, ni siquiera lo están todos los alrededor de 5.500 mamíferos de la Tierra. Para los biólogos, sin incluir las bacterias y los hongos debe haber unos dos millones de especies distintas.

Herbert afirmó que le llevaría apenas siete años crear una "biblioteca" de códigos de barras de ADN en la que se identificaría medio millón de especies, incluidos insectos, invertebrados y peces, a un costo bastante modesto: 100 millones de dólares.

Los esfuerzos para financiar el ya denominado Sistema de Código de Barras de Vida ya están en curso. Esta "biblioteca" ya catalogó más de 25.000 especies. (FIN/IPS/traen-mj/sl/ks/wd sc he en bd/07)(FIN/2007)